Kilka pytań z genetyki molekularnej i stosowanej

[Beja]

Mam problem z następującymi zadaniami:
1. Miejsce występowania w komórce DNA i RNA (DNA tylko w jądrze?)
2. Wyjaśnij, dzięki czemu cząsteczki tRNA różniące się głównie trójką nukleotydów (kodonem) przenoszą różne, ale określone aminokwasy.
3. Określ biologiczny sens obróbki potranskrypcyjnej oraz możliwości, jakie daje ona komórce.
4. Uzupełnić: mRNA: AUGCAGCCAjednoniciowy DNA: _ dwuniciowy DNA: _ (jedna nić) i (druga nić).
5. Podaj nazwy enzymów katalizujących proces mRNA jednoniciowy DNA oraz proces jednoniciowy DNA dwuniciowy DNA.
6. Określ, czy powyższe procesy zachodzą w zdrowej komórce. Jeśli tak - podaj nazwę procesu.
7. Podaj nazwę procesu: polipeptyd białko.
8. Podaj dwie strukturalne różnice między cząsteczkami mRNA i tRNA.
9. Które enzymy biorą udział w przygotowaniu DNA do elektroforezy - enzymy pozostawiające lepkie czy tępe końce?
10. Transformowany plazmid bakteryjny otrzymuje gen odporności na ampicylinę. Wyjaśnij, jakie znaczenie ma używanie takich genów w inżynierii genetycznej.
Z góry dziękuję.

[Batha]

1. Miejsce występowania w komórce DNA i RNA (DNA tylko w jądrze?)

masz na myśli kom eukariotyczną?
RNA może w jądrze, jąderku, cytolpaźmie, rybosomy (buduje je), mitochondrium, chloroplasty
mitochondria i chloroplasty też mają swój DNA

2. Wyjaśnij, dzięki czemu cząsteczki tRNA różniące się głównie trójką nukleotydów (kodonem) przenoszą różne, ale określone aminokwasy.

kod genetyczny jest zdegenerowany, kilka kodonów może kodować ten sam aminokwas

3. Określ biologiczny sens obróbki potranskrypcyjnej oraz możliwości, jakie daje ona komórce.

a co się dzieja w takim procesie? u kogo występuje? odpowiedz sobie na te pytania, a znajdziesz odp

4. Uzupełnić: mRNA: AUGCAGCCAjednoniciowy DNA: _ dwuniciowy DNA: _ (jedna nić) i (druga nić).

w pierwszą lukę dopisz komplenentarne nukleotydy. w drugą lukę przepisz to co było w pierwszej, a w 3 dopisz łańcuch komplementarny do poprzedniego
pamiętaj, że w DNA jest A,T,G,C a w RNA A,U,G,C

5. Podaj nazwy enzymów katalizujących proces mRNA jednoniciowy DNA oraz proces jednoniciowy DNA dwuniciowy DNA.

poszukaj w książce, lub w necie o procesie replikacja

6. Określ, czy powyższe procesy zachodzą w zdrowej komórce. Jeśli tak - podaj nazwę procesu.

jak zrobisz powyższy to się wyjaśni

7. Podaj nazwę procesu: polipeptyd białko.

poszukaj w ksiązec/necie

8. Podaj dwie strukturalne różnice między cząsteczkami mRNA i tRNA.

znajdź rysuki i obejrzyj

9. Które enzymy biorą udział w przygotowaniu DNA do elektroforezy - enzymy pozostawiające lepkie czy tępe końce?
10. Transformowany plazmid bakteryjny otrzymuje gen odporności na ampicylinę. Wyjaśnij, jakie znaczenie ma używanie takich genów w inżynierii genetycznej.

to też musisz sobie poszukać

pokaż, jak zrobiłaś, a ktoś tu to na pewno sprawdzi

[Beja]

Wielkie dzięki batha.

masz na myśli kom eukariotyczną?

Nie jest to określone, więc chyba ogólnie.

Więc wymyśliłam tak:
3. wycięcie i usunięcie intronów oraz łączenie eksonów możliwości: zapisanie informacji genetycznej przy pomocy mniejszej liczby nukleotydów (?)
5. odwrotna transkryptaza i polimeraza DNA (?)
6. proces drugi - replikacja DNA
7. polikondensacja
8. - mRNA to cząsteczka liniowa, a tRNA ma kształt trójlistnej koniczynki
- w tRNA występują wiązania wodorowe między zasadami azotowymi, a w mRNA nie występują
9. pozostawiające lepkie końce (?)
10. taki transformowany plazmid produkuje antybiotyk
Mogłby ktoś sprawdzić?

[Batha]

Nie jest to określone, więc chyba ogólnie.

więc DNA będzie mogło też w cytoplaźmie występować, jak u bakterii.

3. wycięcie i usunięcie intronów oraz łączenie eksonów możliwości: zapisanie informacji genetycznej przy pomocy mniejszej liczby nukleotydów (?)

czyli usunięcie zbędnych fragmentów. prócz tego w obróbce potranskrypcyjnej przyłancza się do końca 5 czapeczka ( cap ) a do końca 3 ogon poliA. choni mRNA przez strawieniem przez egzonukleazy

5. odwrotna transkryptaza i polimeraza DNA (?)

tak

6. proces drugi - replikacja DNA

tak, a ten pierwszy w komórce zainfekowanej przez wirusa.

7, 8 dobrze

9 ligazy

10 taki plazmid wprowadza się do innej komórki, i tak komórka produkuje antybiotyk

[Medycyna Lwów]

kod genetyczny jest zdegenerowany, kilka kodonów może kodować ten sam aminokwas

raczej na odwrót jeden aminokwas moze być kodowany przez kilka kodonów (8wyj. Trp i Met koduje tylko 1 kodon).

2. Wyjaśnij, dzięki czemu cząsteczki tRNA różniące się głównie trójką nukleotydów (kodonem) przenoszą różne, ale określone aminokwasy.

chodzi zapewne o zasadę tolerancji Crica, ze istnieje tolerancja w pasowaniu 3. pozycji antykodonu i 1. kodonu (jednak wszystko w obrebie tablicy kodu genetycznego) - wiecej poczytaj o tym w necie.

9. Które enzymy biorą udział w przygotowaniu DNA do elektroforezy - enzymy pozostawiające lepkie czy tępe końce?

9 ligazy

z tego co pamiętam to raczej restryktazy w tym biorą udziały (inaczej endonukleazy) i pozostawiają one lepkie końce, żeby np. łatwo dopasować jakis marker czy sondę genetyczną.

[Batha]

Cytat:
kod genetyczny jest zdegenerowany, kilka kodonów może kodować ten sam aminokwas
raczej na odwrót jeden aminokwas moze być kodowany przez kilka kodonów (8wyj. Trp i Met koduje tylko 1 kodon).

tak, moja pomyłka

i w 9 też mój błąd, ligazy biarą udział potem

[Sil]

10 taki plazmid wprowadza się do innej komórki, i tak komórka produkuje antybiotyk

Mam wątpliwości. Chodziło o gen odporności na ampicylinę, a nie gen kodujący ten antybiotyk. Gen odporności można wykorzystać np. do wyselekcjonowania bakterii, które uległy transformacji. Przykładowo: chcemy wprowadzić do bakterii gen kodujący jakieś potrzebne nam białko. Gen ten leży na tym samym plazmidzie, co wspomniany gen odporności na ampicylinę, dzięki temu po potraktowaniu całej hodowli antybiotykiem, przeżyją tylko te bakterie, które zawierają ten plazmid.